基因组研究寻找线索帮助解释乳腺癌的差异

一篇关于基因研究的癌症研究博客,该博客评估了乳腺癌分子特征在多大程度上可能有助于解释一些乳腺癌差异。

肿瘤细胞来自治疗后的三阴性乳腺癌患者。

学分:国家癌症研究所

使用了来自非洲裔美国人乳腺癌的最大肿瘤样本之一,研究人员调查了这些肿瘤的分子特征,并将其与患有乳腺癌的白人妇女进行了比较。

5月4日发表在JAMA肿瘤学杂志上的研究结果证实了先前的发现,与白人患者相比,非裔美国患者的诊断年龄较小,更容易发展为侵袭性乳腺癌亚型,包括三阴性乳腺癌,特别是基底样亚型。

,但在调整不同乳腺癌亚型的频率差异后,研究人员发现,从基因改变、基因和蛋白质的表达等分子特征来看,来自非裔美国人和白人的肿瘤绝大多数是相似而非不同的,以及某些DNA片段的拷贝数。

“我们从这些样本中了解到的最重要的一点是,一旦我们解释了亚型的差异,黑人和白人乳腺肿瘤的分子特征实际上并没有太大的差异,”医学博士Olufenmilayo Olopade说。,共同领导这项研究的芝加哥大学的

基因变异

在美国,非裔美国妇女和白人妇女患乳腺癌的几率相似,但非裔美国人更容易死于这种疾病。其中一个原因可能是这种疾病的侵袭性分子亚型在非裔美国女性中比白人女性更常见。

当研究人员分析患者的生殖系DNA时,他们的结论是,非裔美国人和白人乳腺癌分子特征的差异似乎部分是由遗传变异决定的。

“我们发现,乳腺癌分子特征的一部分在种族间是不同的,北卡罗莱纳大学林伯格综合癌症中心的合作者查尔斯·佩罗博士说:“看来,这些特征中的许多都是由生殖系决定的。好消息是,如果不同种族的女性肿瘤的分子特征相同,然后,患者应根据其亚型接受标准治疗,而不分种族,”佩罗博士补充道。

使用癌症基因组图谱

进行研究,奥洛帕德博士和她的同事使用了癌症基因组图谱(TCGA)项目930名妇女的肿瘤和生殖系DNA样本,其中包括154名主要来自非洲的妇女欧洲血统的祖先和776。

这是从非洲裔美国妇女中收集的最大的乳腺肿瘤,已经通过分子和基因测试进行了彻底的鉴定,NCI癌症基因组学中心TCGA项目办公室主任Jean-Claude Zenklusen博士指出。他指出,这些样本是“方便的样本”,这意味着研究人员很容易接触到这些样本,可能无法代表美国人口。

来评估肿瘤的特征,研究人员发现了女性一生中发生的基因突变和肿瘤DNA的其他变化,称为体细胞变化。他们还分析了某些基因和蛋白质的表达,计算了某些DNA片段的拷贝数,并分析了DNA甲基化的模式。

“癌症基因组图谱的美妙之处在于我们能够对每个样本进行六次大规模的分子分析,佩罗博士说:

评估生存率

这项研究的另一个目的是考虑乳腺癌分子特征的种族差异以及与生存率相关的遗传变异。

中位随访时间为29个月,种族与总体生存率无关l、 然而,分析显示,在基于亚型的亚型分析中,具有基底样乳腺癌或三阴性乳腺癌亚型的非裔美国人“倾向于”总体生存率比白人差。

非裔美国妇女比所有类型的白人妇女更可能有更坏的预后,包括最常见的疾病类型,如雌激素受体阳性乳腺癌,奥洛帕德博士指出。

协作和数据共享

作为研究人员,我们需要关注为什么乳腺癌的结果会出现种族差异,”Perou博士说我们知道有些是由于种系的原因,但是我们需要研究其他可能在差异中起作用的遗传和非遗传因素,但她补充道:“这项研究为我们提供了一个路线图,将基因组检测整合到乳腺癌患者的治疗中,以改善患者的预后。”

“我的希望,”她接着说,Zenklusen博士指出:“通过研究人员之间的合作和数据共享,以及通过让少数群体更容易参与研究,我们将改善所有患者的结果,并改善健康公平性。”他说:“科学界可以利用这些数据来回答未来几年的许多问题,并为未来的工作提出假设。”